报告题目：浅谈生物序列优化的计算策略及在疫苗设计中的应用

报 告 人：熊毅  副研究员

时    间：2023年4月2日16：00

地    点：工科楼E1716

报告摘要：

自然界中目前存在或发现的生物分子（如酶、多肽和核酸等）的某些关键性质往往不能满足实际的工业或医疗应用需求。本报告将首先介绍生物分子序列改造或优化中常用的不同计算策略，如定向进化、机器学习等，然后介绍基于Transformer的深度学习方法在pHLA（人类白细胞抗原-多肽）结合亲和力预测、多肽疫苗的抗原序列优化等任务中开发的计算框架及研究进展。

个人简介：

熊毅，副研究员，现任职于上海交通大学生物信息学与生物统计学系（2014年-），上海人工智能实验室顾问科学家（2022年-）。本硕博毕业于武汉大学计算机学院（2002-2011年），曾在美国普渡大学生物学系从事博士后研究（2012-2013年）。研究方向包括：人工智能（机器学习）；生物分子序列设计与优化、药物设计与发现等。在Nature Machine Intelligence、Nucleic Acids Research、Bioinformatics、 Briefings in Bioinformatics等期刊发表论文60余篇。

青岛软件学院、计算机科学与技术学院

2023年3月31日