中国生物信息学学会(筹)计算生物学与生物信息算法研究专委会学术大会暨第二届山东省生物信息学学术大会于2024年5月23日—25日在青岛金沙滩蓝海御华大酒店举行，此次会议由山东省生物信息学会、中国生物信息学学会（筹）计算生物学与生物信息算法研究专委会主办，中国石油大学（华东）、青岛市软件行业产教联盟承办，山东大学、山东科技大学、青岛理工大学、青岛科技大学、青岛大学、康复大学（筹）协办，会议邀请了众多全国生物信息学及相关领域的知名专家，吸引了近200名参会代表，围绕当下生物信息领域最前沿领域组织了一系列高水准的交流报告和学术讨论。

中国石油大学（华东）计算机科学与技术学院、青岛软件学院副院长宋弢教授主持开幕式，宋弢教授对各级领导的积极支持和组织表达了感谢，并介绍说，本次大会旨在加强生物信息与智能健康等基础研究的交流，探索前沿、聚焦未来。参与本次大会的有来自全国各地的生物信息学相关领域的专家、学者，他代表全体组委会成员对所有参会代表表示热烈的欢迎和衷心的感谢。

    中国石油大学（华东）校务委员会副主任、原中国石油大学（华东）党委副书记、副校长刘华东教授代表中国石油大学（华东）向来到青岛西海岸的各位专家、学者表示热烈的欢迎，向全体支持生物信息学发展的领导和朋友们致以最诚挚的感谢和崇高的敬意，向支持中国石油大学（华东）的各界人士表示衷心的感谢。刘华东教授表示，学校于2017年和2022年均进入双一流行业，充分发挥区域与行业的优势，致力于服务山东省新旧动能转换，高度重视学科交叉融合，希望各位专家学者、各位来宾继续关心和支持中国石油大学（华东）和青岛软件学院的发展，最后预祝本次大会圆满成功。

中国生物信息学学会筹建组核心负责人、清华大学孙之荣教授预祝本次大会顺利召开。孙之荣教授介绍了当下生物信息学的发展现状及其重要性，随着生物信息数据的战略价值凸显，生物信息学的发展已经为各国争先抢占的战略高地；基层组织发展迅速，我国生物信息学科技工作者群体已经具有相当的规模，地方生物信息学学会蓬勃发展；生物信息学在理论、应用层面的突破性成果不断涌现，有力地支撑了各个其他学科、新兴产业集群的发展；生物信息学是本世纪重要的新兴交叉学科。孙之荣教授指出要加强基础研究与应用的结合，努力做原创性工作，培养和吸引人才，推动国际合作与交流，加强科普宣传，希望计算生物学与生物信息算法研究专委会、山东省生物信息学发展壮大！

山东省生物信息学会理事长、山东大学李国君教授对中国石油大学（华东）的各级领导的支持表达衷心的感谢，向各位来宾表示热烈的欢迎。李国君教授表示，山东省生物信息学会成立一年多，感谢大家的支持，希望在座的参会代表一如既往的支持，最后，祝大家生活愉快，预祝大会圆满成功。

本次大会邀请了9位特邀报告嘉宾，设置了4个分论坛，涵盖了生物信息算法、基因组学、智能药物分析、复杂疾病信息学、人工智能在生物信息中的应用、单细胞组学等多个前沿领域。与会者们积极分享了在生物信息学、人类健康和疾病研究等方面的最新成果，旨在推动生命科学领域中的计算方法、工具和研究进步，促进生物信息学的发展。

美国佐治亚大学生物信息研究所首任所长、南方科技大学徐鹰教授进行了题为《大数据时代的肿瘤科学通过疾病大数据研究肿瘤的演化》的精彩报告。徐鹰教授介绍了人得肿瘤的原因、为什么不同的肿瘤在不同人身上有不同的行为、为什么有的人不会得肿瘤以及这些与大数据的关系。由生物演化的驱动力，即生存压力->基因突变->有些被选择来适应压力的启发，从生存压力来研究肿瘤。最后，他介绍了肿瘤产生核苷酸的方式、呼吸方式以及慢性发炎与肿瘤的因果关系。

中南大学计算机学院院长、国家杰青李敏教授做了《面向特征的复杂生物医学数据处理方法》的精彩报告。包括基因组三维结构解析、蛋白质-X相互作用预测以及药物靶标预测与分子生成。李敏教授介绍了三维结构解析模型Bacon、蛋白质-X相互作用预测模型DeepPROBBind和DeepDISOBind。最后，介绍了药物研发相关的内容，基于桥点的药物-靶标相互作用预测方法BridgeDPI，以及基于物理评分优化图神经网络的DTA预测模型等。 

国家超级计算长沙中心副主任、长江学者、湖南大学彭绍亮教授做了《神农GPT：多模态大模型》的精彩报告。彭绍亮教授介绍了神农GPT大模型，这是我国药物领域第一个大模型。他表示，目前药物发现已经从计算机辅助药物发现(CADD)发展到人工智能药物发现(AIDD)，但AIDD有主观性强、计算量大和可解性差等缺点。针对这些挑战，他们采用了多任务协同预训练大模型、多模态联合深度学习以及高通量虚拟药物筛选并行可扩展算法和生物分子测试技术。此外，他们自主研发的基于自监督多任务学习的药物发现平台已经成功落地湘雅医院开展试用。

中国计算机学会理论计算机科学专委会常务委员、山东大学朱大铭教授做了《字符串上的侧翼重排距离》的精彩报告。朱大铭教授介绍了基因组的结构发生变化时的一些基本的现象，翻转、转位以及块交换。他指出，重排列之后的最小距离可以研究两个生命之间的距离，如人和小组之间的基因组相差178±38个重排。最后，介绍了一些具体的问题和算法，如前缀块交换排序、侧翼块交换距离可能性问题以及k-FBD问题。

25号上午，内蒙古科技大学学术工作委员会副主任、内蒙古科技大学蔡禄教授做了《整合RNA-seq和Iso-seq数据解析肺纤维化相关可变剪事件的调控机制》的精彩报告。蔡禄教授表示，通过基因表达、可变剪接和细胞间通讯等来理解肺纤维化的机理是目前研究的基本思路。他介绍了肺纤维化的发病原因、目前基于可变剪接的研究方法以及目前二代测序技术和三代测序技术的优缺点。最后介绍了他们组最近的工作，包括整合二代和三代测序技术、对RNA-seq表达定量后的二次校正及产生的结果变化，并成功构建了小鼠肺部纤维化自然吸入染尘模型。

安徽大学科学技术处处长、国家级人才工程科技创新领军人才郑春厚教授做了《生物元件智能预测与设计》的精彩报告，包括AI赋能元件合成、启动子智能预测和启动子智能设计。郑春厚教授介绍了合成生物学，包括自顶向下的设计和自底向下的设计，应用领域非常广泛。他表示，AI为合成生物学带来新的机遇，AI能够实现智能全自动生物合成，具有持续学习能力、以及在位置空间探索的能力。然后介绍了他们在启动子智能预测和启动子设计的内容，如基于深度学习的噬菌体启动子及其类型预测、基于深度学习的微拟球藻启动子预测。

国家杰青、华南理工大学蔡宏民教授做了《多模态生成式AI助力肿瘤精准治疗》的精彩报告。主要介绍了多尺度数据整合分析和完备生成式表征学习，包括多模态信息瓶颈表征学习和多模态超图神经网络等。蔡宏民教授表示，生物信息学逐渐由实验科学转向数据科学，生成式AI推动生物学从科学向工程转变。最后，他提出了对未来工作思考：面向大健康未来构建数字孪生体，完备单细胞生命图谱实现细胞孪生。

中国数学会常务理事、河北师范大学数学科学学院院长苑立平教授做了《On some properties of Archimendean tilings》的精彩汇报。苑立平教授介绍了plane tiling（平面铺砌），这在实际应用中具有很大价值。她介绍了数字几何的几个相关的著名定理，如Minkowski's定理和Pick's定理。最后介绍了扩展到阿基米德tiling的一系列有趣的定理。

青岛海信医疗设备股份有限公司手术室事业部总经理李如意高级工程师做了《微创手术智能化探索》的精彩报告，主要介绍了智能手术如何更好地控制手术过程，提高手术质量。手术过程的智能化管控是AI介入医疗行业的重要方向，但是受限于手术的多样性、医生操作的差异性等，导致AI模型无法在微创外科得以有效地落地。李如意介绍，通过目标识别和语义分割与特征提取的双特征模型，可以提高手术质量。然后介绍了术中导航——三维手术规划系统，这为外科医生提供了精准的三维地图。最后，他表示将持续深耕医疗AI领域，为智能外科赋能。

大会的最后，山东省生物信息学会秘书长，青岛科技大学于彬教授主持闭幕式。于彬教授表示大会的圆满成功离不开各位参与者的共同努力和支持，也感谢各位嘉宾、演讲者和赞助商的大力支持。参会代表纷纷表示感谢组委会的辛苦付出，中国生物信息学学会（筹）计算生物学与生物信息算法研究专委会学术大会暨第二届山东省生物信息学学术大会圆满落幕，大会为生物信息学领域的学术交流提供了一个高水平平台，推动了该领域的发展与创新。