王淑栋
作者:
李钰    
发布时间:
2017-03-13    
点击次数:
   

姓名:王淑栋
性别:
民族:
办公电话:13806445278
职务:
职称:教授,博士生导师
电子邮箱:wangshudong2013@SOHU.COM
个人简介:王淑栋:女,1973年10月生。中国石油大学(华东)三级教授,博士生导师。中国电子学会图论与系统优化专业委员会委员、国家自然科学基金评审专家、山东省自然科学基金结题评审专家。2004年毕业于华中科技大学控制科学与工程系,获工学博士学位;2008年6月北京大学计算机科学与技术流动站出站博士后;2010年在美国Southern Illinois University进行短期学术访问;2011年7月至2014年1月在美国Virginia Commonwealth University生物统计系从事博士后研究工作。目前主要从事生物统计、系统生物学、DNA计算模型的理论和应用等方面的研究。主持国家自然科学基金3项,中国博士后基金1项,山东省优秀中青年科学家科研奖励基金1项,校杰青基金1项;作为主要成员参加国家自然科学基金项目3项,863项目1项,博士点基金1项。在《Discrete Mathematics》、《Graphs and Combinatorics》、《J. Chem. Inf. Comput. Sci.》、《Progress in Natural Science》、《Chinese of Journal Electronics》、《计算机学报》、《电子学报》等杂志上发表学术论文60余篇,其中SCI检索20篇、EI检索27篇;出版译著2部;获2005年度教育部提名国家科学技术奖自然科学一等奖(13人9位),2005年度山东省高等学校优秀科研成果奖自然科学二等奖(5人1位),2010年度山东省青岛市自然科学二等奖(5人1位),2007年度浙江省高等学校优秀科研成果奖自然科学二等奖(5人5位);获发明专利2项:基于环形DNA的图着色计算方法及其DNA计算系统(6人5位)(200910078155.6),基于DNA计算实现的图顶点着色方法和DNA计算系统(6人5位) (200810085571.4).
研究领域

生物统计、系统生物学、DNA计算模型的理论和应用

科研项目

 

1.国家自然科学基金项目:DNA计算模型的理论研究及应用(60503002),2006.1-2008.12,26万,主持人
2. 国家自然科学基金项目:基于网络核与核度理论的基因网络研究(60874036),2009.1-2011.12,37万,主持人
3. 国家自然科学基金项目:复杂基因网络若干理论和应用研究(61170183),2012.1-2015.12,69万,主持人
4. 山东省优秀中青年科学家科研奖励基金:复杂网络方法在基因逻辑网络中的应用研究(BS2011SW025);2012.1-2014.12,5万,主持人
5. 中国国家博士后基金项目:通用WatsonCrick图灵机模型的理论研究与应用(20060400344);2006.6-2008.6, 3万,主持人
6. 校杰出青年奖励基金:复杂基因逻辑网络中的若干理论和应用研究(2010KYJQ104);2010.1-2014.1215主持人
7. 国家自然科学基金项目:DNA 计算在图论与组合优化中的应用(60103021),主要成员
8. 国家自然科学基金项目:基于 DNA 计算的系统优化方法探索(60174047),主要成员
9. 国家自然科学基金项目:DNA计算中的核酸序列设计研究(30670540),主要成员
10. 国家863项目NP完全问题的DNA计算机研制(2006AA01Z104,6/12)
11.博士点基金:NP-完全问题DNA计算机模型研究(20070001020),(2/9),6万,2008.1-2010.12
12. 国家自然科学基金重点项目:图信息处理DNA计算机模型研究(60533010),(6/13),200万,2006.1-2009.12

 

论文及著作

 

 
1.    Shu-Dong Wang, Dong-Ling Chen, Shan-Chen Pang. The Incidence Coloring Number of Halin Graphs and Outerplanar Graphs. Discrete Mathematics, 2002, 256: 397-405. SCI
2.    Shu-Dong Wang, Shan-Chen Pang. The Determination of the Total Chromatic Number of Series-Parallel Graphs with⊿(G)≥4. Graphs and Combinatorics, 2005, 21(4):531-540.SCI
3.    Wang Shudong, Xu Jin, Xu Chunxiang. The ‑Incidence Coloring of Outerplanar Graphs. Progress in Natural Science, 2008, 18(5): 575-578.SCI
4.    Shu-Dong Wang, Jin Xu. Bidirectional Sticker Systems with Complex Structures and Generative Capacity. Chinese of Journal Electronics, 2008, 17(3): 409-413.SCI
5.    Shudong Wang, Yan Chen, Qingyun Wang, Eryan Li, Yansen Su, Dazhi Meng. Analysis for Gene Networks Based on Logical Relationships. Journal of Systems Science and Complexity, 2010, 23(5): 999-1011. SCI
6.    Shudong Wang,Wenan Chen,Guimin Gao. Meta-analysis of Genome-wide Association Studies (GWAS) has Become a Useful Tool to Identify Genetic Variants that are Associated with Complex Human Diseases. Genetic Epidemiology, 2012, 36(7):776-776. (SCI)
7.    Yuanyuan Zhang, Shudong Wang, Meixi Yang, Dashun Xu, Dazhi Meng. A New Method of Determining Threshold of Gene Network based on Phenotypes. Journal of Biological Systems, 2011, 19(3): 1-10. (SCI, 通信作者)
8.    Yu-Lin Zhang, Shu-Dong Wang, Long-Xiao Sun, Yuan-Yuan Zhang, Da-Zhi Meng. Analysis for Cascading Failures with DNA Repair Function of Gene Network and its Application. Biomedical Engineering: Applications, Basis and Communications, 2012, 24(3): 237-244.SCI
9.    Wenbin Liu, Shudong Wang, Lin Gao, Jin Xu. DNA Sequence Design Based on Template Strategy. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2003, 43: 2014-2018.SCI
10.    Wenbin Liu, Lin Gao, Xiangrong Liu, Shudong Wang, Jin Xu. Solving the 3-SAT Problem based on DNA Computing. J. Chem. Inf. Comput. Sci., 2003, 43: 1872-1875.SCI
11.    Liu Wenbin, Zhu Xiangou, Wang Xianghong, Yin Zhixiang, Wang Shudong. Simulating the XOR Gates based on the Induced Hairpin Formation. Current Nanoscience, 2008, 4(1): 108-110.SCI
12.    Zhang Cheng, Yang Jing, Xu Jin, Wang Shudong. A “Nano-dial” Molecular Computing Model based on Circular DNA. Current Nanoscience, 2010, 6(3): 285-291.SCI
13.    Jin Xu, Xiaoli Qiang, Linqiang Pan, Shudong Wang. An Unenumerative DNA Computing Model for Vertex Coloring Problem. IEEE Transactions on Nanobioscience, 2011, 10(2): 94-98. SCI)
14.    Shudong Wang, Songtao Shi, Yanru Ge, Longxiao Sun, Dashun Xu, Dazhi Meng. Analysis and Study of Cascading Failures in Gene Network. Advance in Systems Science and Applications, 2011, 11(1).
15.    Shudong Wang, Yuanyuan Zhang, Kaikai Li, Dazhi Meng. A Novel Analytical Method for Structural Characteristics of Gene Networks and its Application. Computational Molecular Bioscience, 2012, 2(3):92-101.
16.    Shudong Wang, Wenan Chen, Xiangning Chen, Fengjiao Hu, Kellie J. Archer, Nianjun Liu, Shumei Sun, Guimin Gao. Double Genomic Control is not Effective to Correct for Population Stratification in Meta-analysis for Genome-wide Association Studies. Frontiers in Applied Genetic Epidemiology, 2012, 12:1-12.
17.    Wei Liu, Yuanyuan Zhang, Xiuzhu Xu, Meixi Yang, Dashun Xu, Shudong Wang. Structural Analysis of Leukemia Related Gene Network. Advance in Systems Science and Applications, 2011, 11(1).
18.    Xiuzhu Xu, Shudong Wang, Kaikai Li, Dashun Xu, Dazhi Meng. Analysis for Gene Networks of Colon Cancer based on Logical Relationships. Advance in Systems Science and Applications, 2011, 11(1).
19.    Yansen Su, Shudong Wang, Eryan Li, Tao Song, Hui Yu, Dazhi Meng.  Analysis of Gene Logic Networks for Arabidopsis. Current Bioinformatics, 2013, 8.
20.    Wang Shudong. Analysis for Graph Coloring Problem Based on Sticker and Deletion Systems. 计算机学报, 2008, 31(12): 2123-2128. EI
21.    Shu-Dong Wang, Li-Jun Yan, Xiang-Rong Liu. On the Maximum Average Degree and the Incidence Chromatic Number. 北京大学学报,2008, 44(5):727-732.EI
22.    Shu-Dong Wang, Jin Xu, Shan-Chen Pang. The Incidence Strong Edge Coloring Number of SP Graphs. 数学研究与评论, 2005, 25(2):267-278.
23.    Shudong Wang, Kaikai Li, Xiuzhu Xu, Dazhi Meng. Structural Characteristics of Gene Networks for Colon Cancer. 2011 IEEE International Conference on Signal Processing, Communications and Computing, 22-27. EI
24.    Shudong Wang, Lijun Yan. The Relationship between Incidence Coloring and Vertex Coloring of Graphs. Dynamics of Continuous, Discrete and Impulsive Systems, 2007, 14(S3): 917-921.ISTP
25.    Eryan Li, Shudong Wang, Yansen Su, Dashun Xu, Dazhi Meng. Construction and Analysis of Gene Networks for Arabidopsis. 2011 IEEE International Conference on Signal Processing, Communications and Computing, 1190-1195. EI
26.    Su Yansen, Meng Dazhi, Li Eryan, Wang Shudong. Analysis of Gene Networks for Arabidopsis Flowering. TsingHua Science and Technology, 2012, 17(6)682-690.
27.    Liu XiangrongWang Shudong. Development of an in Vivo Computer for 3-SAT Problem. 2009 4th International Conference on Bio-Inspired Computing: Theories and Applications, 328-331.EI
28.    Yafei Dong, Xuedong Zheng, Shudong Wang. Molecule Algorithm for Perfect Matching Problem based on Sticker Models. 2004 International Conference on Intelligent Mechatronics and Automation, p 249-253. EI
29.    Dong Yafei, Wang Shudong. Nature Algorithm for Perfect Matching Problem. Dynamics of Continuous, Discrete and Impulsive Systems, 2007, 14(S3): 939-943.ISTP
30.    Song tao, Wang Shudong, Wang xun. The Design of Reversible Gate and Reversible Sequencial Circuit based on DNA Computing. International Conference on Intelligent System and Knowledge Engineering (ISKE2008), XiaMen, 2008, 11.17-18:114-118.EI
31.    Li Zhen, Wang Shudong, Li Eryan. Partial Words Used for DNA Encoding. IET Seminar Digest, 2008, 3:302-306.EI
32.    Xiangrong Liu, Shudong Wang. Development of an in Vivo computer for 3-SAT Problem. Mathematical and Computer Modelling, 2010, 52: 2043- 2047.EI
33.    王淑栋, 刘文斌, 许进. 基于剪接系统的哈密顿路问题分析. 电子学报, 2005, 33(5): 774-777.EI
34.    王淑栋, , 李二艳. DNA Golay码的设计与分析. 电子学报, 2009, 37(7): 1542-1545.EI
35.    王淑栋, 刘文斌, 许进. 图着色问题的DNA粘贴算法. 系统工程与电子技术, 2005, 27(3): 568-572.EI
36.    王淑栋, 刘文斌, 许进. 图的最小顶点覆盖问题的质粒DNA 计算模型. 华中科技大学学报, 2004, 32(11):59-61.EI
37.    王淑栋,任淑红. 低度系列平行图的邻点可区别全染色. 自然科学进展, 2007, 17(6): 779-788.
38.    王淑栋, 许进, 刘会新. 用混合遗传算法求解图的邻强边着色问题. 系统工程与电子技术, 2003, 25(5): 617-620.
39.    王淑栋, 许进, 董亚非. 图的最小覆盖问题的面上DNA解法. 小型微型计算系统, 2003, 25(2): 242-244.
40.    张成,杨静,王淑栋.. DNA计算中荧光技术的应用及其发展. 计算机学报, 2009, 12: 2300-2311.EI
41.    刘向荣, 王淑栋, 郗方, 陈梅. 最小支配集问题的活体分子计算模型. 计算机学报, 2009, (12): 2325-2331.EI
42.    刘文斌, 高琳, 王淑栋, 刘向荣, 许进. 最大匹配问题的DNA表面计算模型. 电子学报, 2003, 31(10): 496-499.EI
43.    殷志祥, 刘文斌, 董亚非, 王淑栋. DNA计算在组合优化中的应用及其复杂性. 系统工程与电子技术, 2003, 25(4): 427-431.EI
44.    , 王淑栋, 马芳芳. 三元编码法与扩元编码法. 系统工程与电子   技术, 2009, 31(4): 960-963.EI
45.    庞善臣, 王淑栋. 一种基于模式最长前缀正文分割的串匹配新算法. 小型微型计算机系统, 2004, 25(3): 404-406.
46.    刘文斌, 王淑栋, 许进. 可满足性(SAT)问题的几种DNA计算模型. 小型微型计算机系统,2004, 25(10): 1321-1325.
47.    董亚非,王淑栋,许进. DNA计算的粘贴模型及在组合优化中的应用. 华中科技大学学报, 2003, 31(9): 59-61.
48.    闫立军,王淑栋,马芳芳. 系列平行图和Meredith’s图的关联着色. 高校应用数学学报, 2008, 23(4): 481-486.
49.    谷玉盈, 王淑栋. 幂图的邻点可区别全色数. 黑龙江大学自然科学学报, 2008, 25(2): 193-195.
50.    谷玉盈, 王淑栋. Adjacent Vertex Distinguishing Total Chromatic Number of the Mycielski Graphs of Tree. 数学季刊, 2008, 23: 621-624.
51.    杨梅茜, 王淑栋, 张媛媛, 孟大志. 一种挖掘关键基因的新方法及其应用. 生物信息学, 2012,10(2):130-135.
52.    许进, 王淑栋, 潘林强. DNA计算: 一种新的计算模式》, 译著, 清华大学出版社, 2004. 9.

郗方, 王淑栋, 强小丽. DNA计算模型》, 译著, 清华大学出版社, 2010.01.

获得荣誉

 

1. 2005年度教育部提名国家科学技术奖自然科学一等奖:优化计算中若干理论及其应用的研究。(139位):许进,魏小鹏,张强,张军英,殷志祥,刘亚春,王世英,刘文斌,王淑栋,马润年,高琳,潘林强,张凤月;
2. 2005年度山东省高等学校优秀科研成果奖自然科学二等奖:图与仿生计算理论及应用的研究。(51位):王淑栋,刘文斌,刘西奎,陈学刚,庞善臣;
3. 2010年度山东省青岛市自然科学二等奖: 生物计算理论、模型及优化应用。(51位):王淑栋,潘林强,刘文斌,庞善臣,陈学刚;
4. 2007年度浙江省高等学校优秀科研成果奖自然科学二等奖:DNA计算模型及应用研究。(55位):刘文斌,朱翔鸥,张强,刘向荣,王淑栋
5. 第九届山东省青年科技奖,山东省科学技术协会
6. 发明专利:基于环形DNA的图着色计算方法及其DNA计算系统CN200910078155.6。(65位):许进,强小利, 张成, 杨静, 王淑栋,刘向荣.

7. 发明专利:基于DNA计算实现的图顶点着色方法和DNA计算系统CN200810085571.4 。(65位)张成,杨静,许进,刘向荣,王淑栋,强小利.